MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006142	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
2	NC_006142	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473216
3	NC_006142	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
4	NC_006142	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
5	NC_006142	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	51473216
6	NC_006142	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	51473216
7	NC_006142	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473216
8	NC_006142	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473216
9	NC_006142	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473216
10	NC_006142	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473216
11	NC_006142	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	51473216
12	NC_006142	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473216
13	NC_006142	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473216
14	NC_006142	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	51473216
15	NC_006142	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	51473216
16	NC_006142	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	51473216
17	NC_006142	TAACG	2	10	992	1001	40 %	20 %	20 %	20 %	51473217
18	NC_006142	GTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473217
19	NC_006142	ATA	2	6	1098	1103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473217
20	NC_006142	AAAGTA	2	12	1131	1142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	51473217
21	NC_006142	TGA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473217
22	NC_006142	TGT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473217
23	NC_006142	CAA	2	6	1257	1262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473217
24	NC_006142	A	8	8	1261	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	51473217
25	NC_006142	TAA	2	6	1286	1291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473217
26	NC_006142	T	9	9	1404	1412	0 %	100 %	0 %	0 %	51473218
27	NC_006142	A	6	6	1414	1419	100 %	0 %	0 %	0 %	51473218
28	NC_006142	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473218
29	NC_006142	A	6	6	1484	1489	100 %	0 %	0 %	0 %	51473218
30	NC_006142	AT	3	6	1549	1554	50 %	50 %	0 %	0 %	51473218
31	NC_006142	TGC	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473218
32	NC_006142	ACAG	2	8	1632	1639	50 %	0 %	25 %	25 %	51473218
33	NC_006142	ATGCTA	2	12	1657	1668	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51473218
34	NC_006142	TA	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	51473218
35	NC_006142	ATA	3	9	1670	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473218
36	NC_006142	A	7	7	1696	1702	100 %	0 %	0 %	0 %	51473218
37	NC_006142	TGA	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473218
38	NC_006142	GCA	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473218
39	NC_006142	TTAAT	2	10	1883	1892	40 %	60 %	0 %	0 %	51473218
40	NC_006142	GAA	2	6	1893	1898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473218
41	NC_006142	AAT	2	6	1923	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473218
42	NC_006142	AAG	2	6	1940	1945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473218
43	NC_006142	TTA	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473218
44	NC_006142	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473218
45	NC_006142	T	8	8	2078	2085	0 %	100 %	0 %	0 %	51473219
46	NC_006142	A	6	6	2088	2093	100 %	0 %	0 %	0 %	51473219
47	NC_006142	ATT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473219
48	NC_006142	T	6	6	2153	2158	0 %	100 %	0 %	0 %	51473219
49	NC_006142	T	7	7	2213	2219	0 %	100 %	0 %	0 %	51473219
50	NC_006142	T	6	6	2222	2227	0 %	100 %	0 %	0 %	51473219
51	NC_006142	TAG	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473219
52	NC_006142	AGTA	2	8	2294	2301	50 %	25 %	25 %	0 %	51473219
53	NC_006142	ATA	2	6	2343	2348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
54	NC_006142	A	7	7	2348	2354	100 %	0 %	0 %	0 %	51473219
55	NC_006142	T	7	7	2372	2378	0 %	100 %	0 %	0 %	51473219
56	NC_006142	TA	3	6	2404	2409	50 %	50 %	0 %	0 %	51473219
57	NC_006142	TTTTA	2	10	2444	2453	20 %	80 %	0 %	0 %	51473219
58	NC_006142	ATA	2	6	2481	2486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
59	NC_006142	TTAT	2	8	2605	2612	25 %	75 %	0 %	0 %	51473219
60	NC_006142	TAAT	2	8	2719	2726	50 %	50 %	0 %	0 %	51473219
61	NC_006142	ATG	2	6	2742	2747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473219
62	NC_006142	TAA	2	6	2749	2754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473219
63	NC_006142	TTA	2	6	2776	2781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473219
64	NC_006142	ATTTA	2	10	2797	2806	40 %	60 %	0 %	0 %	51473219
65	NC_006142	TTAT	2	8	2827	2834	25 %	75 %	0 %	0 %	51473219
66	NC_006142	A	6	6	2891	2896	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
67	NC_006142	ATT	2	6	2984	2989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
68	NC_006142	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
69	NC_006142	T	6	6	3040	3045	0 %	100 %	0 %	0 %	51473220
70	NC_006142	AAG	2	6	3069	3074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
71	NC_006142	A	7	7	3154	3160	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
72	NC_006142	GCAAA	2	10	3254	3263	60 %	0 %	20 %	20 %	51473220
73	NC_006142	GAA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
74	NC_006142	TC	3	6	3294	3299	0 %	50 %	0 %	50 %	51473220
75	NC_006142	AGC	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
76	NC_006142	GTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473220
77	NC_006142	TCA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
78	NC_006142	CAA	2	6	3413	3418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473220
79	NC_006142	GAT	2	6	3443	3448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
80	NC_006142	A	7	7	3449	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
81	NC_006142	A	7	7	3468	3474	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
82	NC_006142	GA	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	51473220
83	NC_006142	T	6	6	3505	3510	0 %	100 %	0 %	0 %	51473220
84	NC_006142	ATT	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
85	NC_006142	TATT	2	8	3547	3554	25 %	75 %	0 %	0 %	51473220
86	NC_006142	AGGATA	2	12	3564	3575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	51473220
87	NC_006142	A	6	6	3693	3698	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
88	NC_006142	AGC	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
89	NC_006142	TAT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
90	NC_006142	GCA	2	6	3779	3784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
91	NC_006142	A	7	7	3831	3837	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
92	NC_006142	AGA	2	6	3880	3885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
93	NC_006142	AT	4	8	3914	3921	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
94	NC_006142	CTT	2	6	3923	3928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473220
95	NC_006142	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
96	NC_006142	AGAA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	51473220
97	NC_006142	AT	3	6	4224	4229	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
98	NC_006142	GA	3	6	4244	4249	50 %	0 %	50 %	0 %	51473220
99	NC_006142	AAT	3	9	4250	4258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
100	NC_006142	ATG	2	6	4269	4274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
101	NC_006142	TGA	2	6	4422	4427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
102	NC_006142	CTAATA	2	12	4461	4472	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51473220
103	NC_006142	ATA	2	6	4496	4501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
104	NC_006142	GGT	3	9	4502	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473220
105	NC_006142	CTT	2	6	4515	4520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473220
106	NC_006142	GCA	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473220
107	NC_006142	AGA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
108	NC_006142	TA	3	6	4583	4588	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
109	NC_006142	AGA	3	9	4603	4611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
110	NC_006142	GAA	2	6	4625	4630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
111	NC_006142	GTT	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473220
112	NC_006142	AAG	2	6	4656	4661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
113	NC_006142	GAA	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
114	NC_006142	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
115	NC_006142	TAA	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
116	NC_006142	TAT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
117	NC_006142	TAAAT	2	10	4753	4762	60 %	40 %	0 %	0 %	51473220
118	NC_006142	AT	3	6	4775	4780	50 %	50 %	0 %	0 %	51473220
119	NC_006142	ATA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
120	NC_006142	GAT	3	9	5015	5023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
121	NC_006142	GTAGT	2	10	5064	5073	20 %	40 %	40 %	0 %	51473220
122	NC_006142	AAG	2	6	5094	5099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473220
123	NC_006142	AAT	2	6	5129	5134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
124	NC_006142	ATT	2	6	5181	5186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
125	NC_006142	TAA	2	6	5203	5208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
126	NC_006142	AATA	2	8	5209	5216	75 %	25 %	0 %	0 %	51473220
127	NC_006142	TCAC	2	8	5248	5255	25 %	25 %	0 %	50 %	51473220
128	NC_006142	TGC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473220
129	NC_006142	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	51473220
130	NC_006142	ATT	2	6	5304	5309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
131	NC_006142	TCGATA	2	12	5355	5366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51473220
132	NC_006142	CTA	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
133	NC_006142	AGT	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473220
134	NC_006142	CAC	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51473220
135	NC_006142	A	7	7	5498	5504	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
136	NC_006142	ATT	3	9	5507	5515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
137	NC_006142	TTA	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473220
138	NC_006142	AAAATA	2	12	5559	5570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51473220
139	NC_006142	A	6	6	5599	5604	100 %	0 %	0 %	0 %	51473220
140	NC_006142	TAA	2	6	5631	5636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473220
141	NC_006142	TCA	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473220
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259	NC_006142	TGT	2	6	11290	11295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473225
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265	NC_006142	ATTAAA	2	12	11541	11552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473226
266	NC_006142	AT	4	8	11627	11634	50 %	50 %	0 %	0 %	51473226
267	NC_006142	TA	3	6	11650	11655	50 %	50 %	0 %	0 %	51473226
268	NC_006142	TAA	2	6	11713	11718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473226
269	NC_006142	A	7	7	11728	11734	100 %	0 %	0 %	0 %	51473226
270	NC_006142	T	6	6	11848	11853	0 %	100 %	0 %	0 %	51473226
271	NC_006142	ATT	3	9	11936	11944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
272	NC_006142	TTA	2	6	11987	11992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
273	NC_006142	ATA	2	6	11999	12004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473227
274	NC_006142	TTA	2	6	12011	12016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
275	NC_006142	TAAT	2	8	12024	12031	50 %	50 %	0 %	0 %	51473227
276	NC_006142	TCT	2	6	12032	12037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473227
277	NC_006142	GCTT	2	8	12039	12046	0 %	50 %	25 %	25 %	51473227
278	NC_006142	AT	3	6	12047	12052	50 %	50 %	0 %	0 %	51473227
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280	NC_006142	CTA	2	6	12122	12127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473227
281	NC_006142	ATT	2	6	12166	12171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
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283	NC_006142	TTA	3	9	12218	12226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
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285	NC_006142	TAA	2	6	12255	12260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473227
286	NC_006142	ATT	2	6	12295	12300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
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289	NC_006142	TAT	2	6	12477	12482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473227
290	NC_006142	TGA	2	6	12485	12490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473227
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292	NC_006142	CT	3	6	12515	12520	0 %	50 %	0 %	50 %	51473227
293	NC_006142	TGC	2	6	12555	12560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473227
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296	NC_006142	GTA	2	6	12657	12662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473227
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390	NC_006142	TAA	2	6	17290	17295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473229
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392	NC_006142	TTCA	2	8	17361	17368	25 %	50 %	0 %	25 %	51473229
393	NC_006142	ATTTAA	2	12	17371	17382	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
394	NC_006142	AAT	2	6	17393	17398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473229
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396	NC_006142	ACA	2	6	17452	17457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473229
397	NC_006142	AGATA	2	10	17506	17515	60 %	20 %	20 %	0 %	51473229
398	NC_006142	ATT	2	6	17517	17522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473229
399	NC_006142	CAT	2	6	17558	17563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473229
400	NC_006142	AATTAT	2	12	17594	17605	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
401	NC_006142	TAT	2	6	17620	17625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473229
402	NC_006142	TA	4	8	17671	17678	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
403	NC_006142	A	6	6	17700	17705	100 %	0 %	0 %	0 %	51473229
404	NC_006142	AAT	2	6	17726	17731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473229
405	NC_006142	AT	3	6	17730	17735	50 %	50 %	0 %	0 %	51473229
406	NC_006142	TAA	2	6	17791	17796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473229
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432	NC_006142	TAT	2	6	20321	20326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473231
433	NC_006142	CT	4	8	20337	20344	0 %	50 %	0 %	50 %	51473231
434	NC_006142	TGC	2	6	20436	20441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473231
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436	NC_006142	CTG	2	6	20473	20478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473231
437	NC_006142	TA	3	6	20552	20557	50 %	50 %	0 %	0 %	51473231
438	NC_006142	GA	3	6	20623	20628	50 %	0 %	50 %	0 %	51473231
439	NC_006142	A	6	6	20634	20639	100 %	0 %	0 %	0 %	51473231
440	NC_006142	TATTT	2	10	20675	20684	20 %	80 %	0 %	0 %	51473231
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445	NC_006142	ATA	2	6	20901	20906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473231
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452	NC_006142	T	6	6	21031	21036	0 %	100 %	0 %	0 %	51473231
453	NC_006142	T	6	6	21052	21057	0 %	100 %	0 %	0 %	51473231
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462	NC_006142	TAT	2	6	21380	21385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473232
463	NC_006142	CCT	2	6	21400	21405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51473232
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465	NC_006142	CAA	2	6	21461	21466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51473232
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478	NC_006142	TA	3	6	22106	22111	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
479	NC_006142	T	7	7	22135	22141	0 %	100 %	0 %	0 %	51473233
480	NC_006142	AT	4	8	22149	22156	50 %	50 %	0 %	0 %	51473233
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487	NC_006142	ATA	2	6	22422	22427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473233
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